RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ALAS2P22557 587 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GAS1P54826 345 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GALK2Q01415 458 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PAQR6Q6TCH4 344 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF44Q7L0R7 432 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 UBASH3BQ8TF42 649 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PCBD2Q9H0N5 130 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PELI2Q9HAT8 420 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SERTAD3Q9UJW9 196 aa24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 STMND1H3BQB6 276 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GZMKP49863 264 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN10Q6JVE6 187 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF767PQ75MW2 155 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 VASH2Q86V25 355 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K5Q8NGD3 323 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BBS10Q8TAM1 723 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NKD1Q969G9 470 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TM4SF18Q96CE8 201 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A2Q96QD8 506 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A5Q96R48 311 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZPBPQ9BS86 351 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R7Q9NYW3 318 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAM29Q9UKF5 820 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPR1Q14643 2758 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YGG7 62 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST10O43529 356 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC28A2O43868 658 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC43A1O75387 559 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSM1Q08AH1 577 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAPC1Q16533 368 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRC1Q96M27 445 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNT4Q9C0J1 378 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L10Q9HD36 194 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PLSCR3Q9NRY6 295 aa24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0B4J293 547 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C70A6NIJ9 312 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SGK494L7N484 410 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK10O43240 276 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC2LP0C7M8 214 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP11P24347 488 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TGM4P49221 684 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TATDN3Q17R31 274 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZER1Q7Z7L7 766 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N402 240 aa24.3■■□□□ 1.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 KCNE4Q8WWG9 221 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RFKQ969G6 155 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RNFT2Q96EX2 444 aa24.3■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 P2RX6O15547 441 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ORC5O43913 435 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC19A2O60779 497 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN20P56880 219 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CD83Q01151 205 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX47Q8TBZ9 253 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NT5DC2Q9H857 520 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAMF7Q9NQ25 335 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXW2Q9UKT8 454 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BOLA1Q9Y3E2 137 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 BCL6P41182 706 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCT3P49368 545 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 CREB3L2Q70SY1 520 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SPACA3Q8IXA5 215 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52P1PQ8NH57 321 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MARVELD1Q9BSK0 173 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX12Q9BXU0 123 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GIMAP4Q9NUV9 329 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 SCN3AQ9NY46 2000 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM8BA6NDV4 472 aa24.28■■□□□ 1.48
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