RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA1024LP59773 190 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 OR1Q1Q15612 314 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF542PQ5EBM4 170 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 METRNLQ641Q3 311 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 LILRA6Q6PI73 481 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 TRILQ7L0X0 811 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 PATE1Q8WXA2 126 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNJ15Q99712 375 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 MED18Q9BUE0 208 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa16.09■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 NPR2P20594 1047 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 EDNRAP25101 427 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 STPG1Q5TH74 334 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4N2Q8NGD1 307 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4C6Q8NH72 309 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 TIMP4Q99727 224 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNK15Q9H427 330 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 CYSLTR2Q9NS75 346 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 IL20Q9NYY1 176 aa16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
KCNQ1-201ENST00000155840 F3P13726 295 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 PCSK2P16519 638 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 FGL2Q14314 439 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 GLRX5Q86SX6 157 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 OAFQ86UD1 273 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 COX18Q8N8Q8 333 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM239Q8WW34 195 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CHFRQ96EP1 664 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.08■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 H7C1C5 153 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 MT-ND5P03915 603 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 GABRA3P34903 492 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 PGDP52209 483 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 LCN6P62502 163 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC36A2Q495M3 483 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 VITQ6UXI7 678 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 FCRLAQ7L513 359 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 HOMEZQ8IX15 550 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 SOSTQ9BQB4 213 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CLDND1Q9NY35 253 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR171O14626 319 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 SELENOFO60613 162 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RLN1P04808 185 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 GDNFP39905 211 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RAD52P43351 418 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB28P51157 221 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CCR4P51679 360 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ERV3-1Q14264 604 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 GRK1Q15835 563 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RPE65Q16518 533 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF767PQ75MW2 155 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 LCN9Q8WX39 176 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC19A2O60779 497 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 CISD3P0C7P0 127 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 BLVRAP53004 296 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 IRF4Q15306 451 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 OR8S1Q8NH09 359 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ZPLD1Q8TCW7 415 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 YIPF5Q969M3 257 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 HS6ST2Q96MM7 605 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNE5Q9UJ90 142 aa16.07■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 LILRB3O75022 631 aa16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 RAF1P04049 648 aa16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 THBS2P35442 1172 aa16.06■□□□□ 0.16
KCNQ1-201ENST00000155840 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms