RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PTPN18	Q99952	460 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAM2	Q99965	735 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CD84	Q9UIB8	345 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GVT2	93 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM129	A0AVI4	362 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM218	A2RU14	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FRS3	O43559	492 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB3D	O95716	219 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RPN2	P04844	631 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CKB	P12277	381 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TGM3	Q08188	693 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MLIP	Q5VWP3	458 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895		Q6ZTK2	550 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TPRA1	Q86W33	373 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR150	Q8NGU9	434 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51A7	Q8NH64	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OPA3	Q9H6K4	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CKLF	Q9UBR5	152 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SYT5	O00445	386 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CCS	O14618	274 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SEC14L5	O43304	696 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MAS1	P04201	325 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	WNT1	P04628	370 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TACR2	P21452	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ITGB7	P26010	798 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	THPO	P40225	353 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CTSC	P53634	463 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	RNF151	Q2KHN1	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	COMMD2	Q86X83	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A1B0GUH1	482 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	IMPA2	O14732	288 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF208	O43345	1280 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GMFG	O60234	142 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST1H2AB	P04908	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	BDKRB2	P30411	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	OR7A5	Q15622	319 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM205	Q6UW68	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NAXD	Q8IW45	347 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SAMD8	Q96LT4	415 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	QSOX1	O00391	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAM10	O14672	748 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HEXB	P07686	556 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CLU	P10909	449 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MGMT	P16455	207 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	NDUFV2	P19404	249 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	PRSS3	P35030	304 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CAMLG	P49069	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	THAP4	Q8WY91	577 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SPIN3-231	ENST00000639895	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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