RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT2A3Q6UWM9 527 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 RRM2BQ7LG56 351 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10G3Q8NGC4 313 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 UCK2Q9BZX2 261 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa22.75■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf51A8MQB3 221 aa22.74■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 EPHA2P29317 976 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 OMPP47874 163 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SSR4P51571 173 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CCR4P51679 360 aa22.74■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 CD300LDQ6UXZ3 194 aa22.74■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 MPP4Q96JB8 637 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 MUS81Q96NY9 551 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF426Q9BUY5 554 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 REV1Q9UBZ9 1251 aa22.74■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 ENOPH1Q9UHY7 261 aa22.74■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 GATA6Q92908 595 aa22.73■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPA33Q99795 319 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53I11O14683 189 aa22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 IL18R1Q13478 541 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF10Q5QP82 559 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5W2Q8NH69 310 aa22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf49Q96BT1 292 aa22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM81Q6P7N7 255 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF524Q96C55 264 aa22.72■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT9Q9HCQ5 603 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 KLRF1Q9NZS2 232 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SELENONQ9NZV5 590 aa22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF4O43474 513 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTM3P21266 225 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP3P42574 277 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS6KA3P51812 740 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 BICRALQ6AI39 1079 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.71■■□□□ 1.23
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CAPNS1-215ENST00000628018 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WUJ7 227 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TRABD2BA6NFA1 517 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53P04637 393 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PGCP20142 388 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ITPKBP27987 946 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC1A3P43003 542 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CHN2P52757 468 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 CRISP1P54107 249 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKCDQ05655 676 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM156Q8N614 296 aa22.7■■□□□ 1.22
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