RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 AGAP6Q5VW22 663 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIQKQ629K1 86 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 LNX2Q8N448 690 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC9Q92623 222 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OTULINQ96BN8 352 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 AGAP4Q96P64 663 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 G6PC3Q9BUM1 346 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 IFT27Q9BW83 186 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 UBQLN3Q9H347 655 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 IL21RQ9HBE5 538 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 POMT2Q9UKY4 750 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO7AQ13402 2215 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC182A6NF36 153 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 WWP2O00308 870 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 DLL1O00548 723 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1G1O75348 118 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNK2O95069 426 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CH25HO95992 272 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MT-ND5P03915 603 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 IL7P13232 177 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 GABRG2P18507 467 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL9P24844 172 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HTR2AP28223 471 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 GABRA3P34903 492 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CASP3P42574 277 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MTNR1BP49286 362 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR143P51810 404 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2B6P58173 313 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXC5Q00444 222 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ID2Q02363 134 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HHEXQ03014 270 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MXD1Q05195 221 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PYDC2Q56P42 97 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNJQ5T5M9 372 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PARGQ86W56 976 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CPOQ8IVL8 374 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF595Q8IYB9 648 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAIQ8N9R8 606 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR13H1Q8NG92 308 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4C6Q8NH72 309 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGB4Q8WW32 186 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM203Q969S6 136 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ZG16BQ96DA0 208 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 NDC1Q9BTX1 674 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 DPH1Q9BZG8 443 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TPK1Q9H3S4 243 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9N2J8 555 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCB9Q9NP78 766 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CMC2Q9NRP2 79 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CLDND1Q9NY35 253 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms