RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	DMTN	Q08495	405 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	EPS8	Q12929	822 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	FXN	Q16595	210 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RAET1L	Q5VY80	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SFXN2	Q96NB2	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TIMP4	Q99727	224 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ACER3	Q9NUN7	267 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	STOML1	Q9UBI4	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900		J3QKU1	62 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CXCR6	O00574	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PRRG2	O14669	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GSTA4	O15217	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GMFG	O60234	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TPST1	O60507	370 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ATP5H	O75947	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	NTN1	O95631	604 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	EPPIN	O95925	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	LGI1	O95970	557 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PEPD	P12955	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CPN1	P15169	458 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CD247	P20963	164 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GNLY	P22749	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ELK4	P28324	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	HTR3A	P46098	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	CRYBA2	P53672	197 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	BNIP1	Q12981	228 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	QPRT	Q15274	297 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	DUSP7	Q16829	419 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	WLS	Q5T9L3	541 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	TAMM41	Q96BW9	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	MED12	Q93074	2177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKN1-208	ENST00000586900	ADAM11	O75078	769 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	WDR1	O75083	606 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	OPN1SW	P03999	348 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FES	P07332	822 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GP1BB	P13224	206 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GGT1	P19440	569 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RYK	P34925	604 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	PTGER4	P35408	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SLC1A3	P43003	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	CA7	P43166	264 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	LHX2	P50458	406 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RASSF2	P50749	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SESN3	P58005	492 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	COPZ1	P61923	177 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RAC1	P63000	192 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	2e-6	■■■■□ 22.8
PKN1-208	ENST00000586900	NRF1	Q16656	503 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GRINA	Q7Z429	371 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	EID3	Q8N140	333 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	FIG4	Q92562	907 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	ADAM19	Q9H013	955 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKN1-208	ENST00000586900	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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