RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MKLN1Q9UL63 735 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF175Q9Y473 711 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MED12LQ86YW9 2145 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SERINC4A6NH21 518 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GJE1A6NN92 205 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 A8MXE2 369 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF195O14628 629 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF11O14788 317 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF264O43296 627 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL13O43927 109 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FCMRO60667 390 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SCN2BO60939 215 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SLC22A3O75751 556 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF13O75888 250 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 UBOX5O94941 541 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CSTAP01040 98 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 IL6P05231 212 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GSNP06396 782 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CRHP06850 196 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 UBL4AP11441 157 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 EPXP11678 715 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FCGR2AP12318 317 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 IDO1P14902 403 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 IL12AP29459 219 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SFTPDP35247 375 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 KHKP50053 298 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CTBP2P56545 445 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CARD18P57730 90 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC74AQ0VAA2 488 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CBFBQ13951 182 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GSTA3Q16772 222 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SAXO2Q658L1 398 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 HBMQ6B0K9 141 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 VWA1Q6PCB0 445 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GGNQ86UU5 652 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RNF130Q86XS8 419 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 METTL25Q8N6Q8 603 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OR5W2Q8NH69 310 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OR10D3Q8NH80 312 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO27Q8NI29 283 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OSTF1Q92882 214 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ROPN1LQ96C74 230 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 STARD4Q96DR4 205 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SPDL1Q96EA4 605 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MARK4Q96L34 752 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL15Q96M94 604 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NPAS1Q99742 590 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 INPP5KQ9BT40 448 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RNF122Q9H9V4 155 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TIGARQ9NQ88 270 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT8Q9NY28 637 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC4AQ9UMR7 237 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 PROCRQ9UNN8 238 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 WDR45Q9Y484 360 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0J9YW62 118 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 C7orf72A4D263 438 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 A6NNC1 897 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 RFXANKO14593 260 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 MSTNO14793 375 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 KLF11O14901 512 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 UBDO15205 165 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 OIP5O43482 229 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 CTAG2O75638 210 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 UGT2B17O75795 530 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 AQP8O94778 261 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 KRT75O95678 551 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 LINGO3P0C6S8 592 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 POU2F1P14859 743 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 ADH6P28332 368 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms