RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 FBXO27Q8NI29 283 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 WDR20Q8TBZ3 569 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 POC1BQ8TC44 478 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MRAPQ8TCY5 172 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RAB39BQ96DA2 213 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ARL5BQ96KC2 179 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OR5B2Q96R09 309 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RHOJQ9H4E5 214 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 BEX1Q9HBH7 125 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MALT1Q9UDY8 824 aa8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PNR3 127 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SYCE1LA8MT33 242 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 UBXN8O00124 270 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GPR171O14626 319 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CRYBA1P05813 215 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ADRA2AP08913 450 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GFAPP14136 432 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ACHEP22303 614 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OMGP23515 440 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PAX7P23759 505 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SLC29A2Q14542 456 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 FRG2Q64ET8 278 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CASP12Q6UXS9 341 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 APOOLQ6UXV4 268 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZPA2 131 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 WDR31Q8NA23 367 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 FRG2BQ96QU4 278 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 IPPKQ9H8X2 491 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OXSMQ9NWU1 459 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PSAT1Q9Y617 370 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.38□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TTC36A6NLP5 189 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SLITRK5O94991 958 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ITGA5P08648 1049 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 LINGO3P0C6S8 592 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GABRA3P34903 492 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PRIM2P49643 509 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM33P57088 247 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2H2Q13888 395 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 SGO1Q5FBB7 561 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 C3orf33Q6P1S2 294 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM107Q6UX40 140 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RAPH1Q70E73 1250 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GAS2L3Q86XJ1 694 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PDIK1LQ8N165 341 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OR4F5Q8NH21 305 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GPR151Q8TDV0 419 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 RDH5Q92781 318 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 LRRC58Q96CX6 371 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ACOT9Q9Y305 439 aa8.37□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WV62 115 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 KLF11O14901 512 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 PLPP2O43688 288 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 NGFRP08138 427 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-211ENST00000559460 ELK3P41970 407 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms