RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 ELK4P28324 431 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 PGM1P36871 562 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 EIF1P41567 113 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 CCR4P51679 360 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 FGFBP1Q14512 234 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 QPRTQ15274 297 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 GPAT3Q53EU6 434 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 OR2A2Q6IF42 318 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.72■□□□□ 0.59
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CS-222ENST00000550996 KLHL15Q96M94 604 aa18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 CCDC28BQ9BUN5 200 aa18.72■□□□□ 0.59
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CS-222ENST00000550996 SIRPAP78324 504 aa18.71■□□□□ 0.59
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CS-222ENST00000550996 GTF2H4Q92759 462 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
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CS-222ENST00000550996 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.71■□□□□ 0.59
CS-222ENST00000550996 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 ETFAP13804 333 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 ME2P23368 584 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 SORDQ00796 357 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 CBFBQ13951 182 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 HBMQ6B0K9 141 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 LINC01560Q8TB33 94 aa18.7■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 COQ10BQ9H8M1 238 aa18.7■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 SLC24A3Q9HC58 644 aa18.7■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 CLEC4AQ9UMR7 237 aa18.7■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 LURAP1LQ8IV03 231 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 LRRC46Q96FV0 321 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 RMND5AQ9H871 391 aa18.69■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 FAM221AA4D161 298 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 AGAP5A6NIR3 686 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 CTAG2O75638 210 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 FCGR2AP12318 317 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 CAPN3P20807 821 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 PEX19P40855 299 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 STX1BP61266 288 aa18.68■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 KCNJ10P78508 379 aa18.68■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.68■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.68■□□□□ 0.58
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CS-222ENST00000550996 NRGNQ92686 78 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 TUBAL3A6NHL2 446 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-222ENST00000550996 EDF1O60869 148 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
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