RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 BORCS7Q96B45 105 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 KIF25Q9UIL4 384 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 ACTL6BO94805 426 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 VAMP5O95183 116 aa7.95□□□□□ -1.14
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