RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 RNF130Q86XS8 419 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 RNF148Q8N7C7 305 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 MZB1Q8WU39 189 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.82□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 STX16O14662 325 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 PCDH17O14917 1159 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 GUCY1B2O75343 617 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 ATP6V1B1P15313 513 aa6.81□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 CARD17Q5XLA6 110 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 C7orf26Q96N11 449 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 COL21A1Q96P44 957 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 DVL2O14641 736 aa6.81□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 DDCP20711 480 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 PRDX6P30041 224 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 EVI2BP34910 448 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 CDKN1AP38936 164 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ETV4P43268 484 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZNF136P52737 540 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 PIGGQ5H8A4 983 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 PLCZ1Q86YW0 608 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 SIAH3Q8IW03 269 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZNF681Q96N22 645 aa6.81□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PPR1 153 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 PPM1BO75688 479 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 BPGMP07738 259 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 TNFRSF1BP20333 461 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 GALNSP34059 522 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 SLC18A2Q05940 514 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 MGAT2Q10469 447 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 MERTKQ12866 999 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 COX20Q5RI15 118 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 OSTF1Q92882 214 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 TMCO6Q96DC7 493 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 OR52E6Q96RD3 313 aa6.8□□□□□ -1.32
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CS-212ENST00000548567 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 CTBP2P56545 445 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 MAPK14Q16539 360 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 GALNT7Q86SF2 657 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-212ENST00000548567 LINC00471Q8N535 108 aa6.8□□□□□ -1.32
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