RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	ADAMDEC1	O15204	470 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	OIP5	O43482	229 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	SERPINB7	O75635	380 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	GLI4	P10075	376 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	PRKCA	P17252	672 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	SCARB2	Q14108	478 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	VEZF1	Q14119	521 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	DCST1	Q5T197	706 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	WNT2B	Q93097	391 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	MAL2	Q969L2	176 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ADD1-223	ENST00000538860	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	GJE1	A6NN92	205 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ZG16	O60844	167 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	NUDT14	O95848	222 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	UQCRB	P14927	111 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ME2	P23368	584 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	HTR3A	P46098	478 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	STAR	P49675	285 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	MTPN	P58546	118 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	PLAUR	Q03405	335 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	PMPCA	Q10713	525 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ART3	Q13508	389 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF550	Q7Z398	422 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	NFKBID	Q8NI38	313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	TM9SF2	Q99805	663 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CFAP73	A6NFT4	308 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	C8B	P07358	591 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CHRNB4	P30926	498 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	PCGF2	P35227	344 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CLDN15	P56746	228 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	SESN3	P58005	492 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	QPRT	Q15274	297 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	HSPB2	Q16082	182 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	GGN	Q86UU5	652 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ADD1-223	ENST00000538860	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.38	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms