RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530309.1

CASP4-208, Transcript of caspase 4, human

TSL 2

Gene CASP4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP4-208	ENST00000530309	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	MS4A14	Q96JA4	679 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309		A0A1B0GWB2	263 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309		A8MU10	97 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SULT2B1	O00204	365 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	HDAC3	O15379	428 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TPST2	O60704	377 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PTMS	P20962	102 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	UQCRC2	P22695	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PPT1	P50897	306 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	CBX1	P83916	185 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	KYAT1	Q16773	422 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309		G3V4G9	280 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	BTN3A3	O00478	584 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	LRAT	O95237	230 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	UGT2B4	P06133	528 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	NTS	P30990	170 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	CUL1	Q13616	776 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF79	Q15937	498 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	HCN1	O60741	890 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	STX17	P56962	302 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	SMIM14	Q96QK8	99 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CASP4-208	ENST00000530309	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309		K7EQM0	130 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	RS1	O15537	224 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	PRKY	O43930	277 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CASP4-208	ENST00000530309	ECI2	O75521	394 aa		4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms