RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 COPZ1P61923 177 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 TLE1Q04724 770 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 EPS8Q12929 822 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A53Q5H9E4 307 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 MTX3Q5HYI7 312 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 RAET1LQ5VY80 246 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 SMYD1Q8NB12 490 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF563Q8TA94 476 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 SARAFQ96BY9 339 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 ASB9Q96DX5 294 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 THTPAQ9BU02 230 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 VDAC3Q9Y277 283 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 LGI1O95970 557 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 FESP07332 822 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CELA3AP09093 270 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CD247P20963 164 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 HTR3AP46098 478 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CRYBA2P53672 197 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 DLX5P56178 289 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 SELENOWP63302 87 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 QPRTQ15274 297 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 DUSP7Q16829 419 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CBLL1Q75N03 491 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 SFXN2Q96NB2 322 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ARPC2O15144 300 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GMFGO60234 142 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ZIC3O60481 467 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 PRKCAP17252 672 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 NRF1Q16656 503 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM44Q2T9K0 475 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ARSKQ6UWY0 536 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GFRALQ6UXV0 394 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ATCAYQ86WG3 371 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 MIB2Q96AX9 1013 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGDIGQ99819 225 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.96■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 BCKDKO14874 412 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 TPST1O60507 370 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 FMO6PO60774 539 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINA1P01009 418 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GFRA1P56159 465 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GRINAQ7Z429 371 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ACER3Q9NUN7 267 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 LIPGQ9Y5X9 500 aa16.95■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GSC2O15499 205 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 EPPINO95925 133 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GP1BBP13224 206 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 NCK1P16333 377 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 RYKP34925 604 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 MAP2K6P52564 334 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 SPPL2CQ8IUH8 684 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 LSMEM1Q8N8F7 131 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF559Q9BR84 538 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM15Q9C019 465 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM2Q9C040 744 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 CFAP46Q8IYW2 2715 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GTH9 108 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 OR2M5A3KFT3 312 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 PDE5AO76074 875 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 NTN1O95631 604 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF682O95780 498 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 GKN3PP0CG01 181 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 SLC1A3P43003 542 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 SESN3P58005 492 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRK-218ENST00000525459 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.7 ms