RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 UMPSP11172 480 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DCTP40126 519 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NUDT2P50583 147 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CHRNEQ04844 493 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NPSR1Q6W5P4 371 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 RPTNQ6XPR3 784 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA21Q7Z572 469 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZAR1Q86SH2 424 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC35A4Q96G79 324 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf26Q96N11 449 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OR5B2Q96R09 309 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MEAF6Q9HAF1 191 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 JMJD1CQ15652 2540 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO1GB0I1T2 1018 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ACOX3O15254 700 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CEACAM4O75871 244 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 STAMBPO95630 424 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ONECUT2O95948 504 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV3-9P01782 118 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ACP2P11117 423 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 UQCRC2P22695 453 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP2K6P52564 334 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DSTNP60981 165 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GSTA3Q16772 222 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ARSKQ6UWY0 536 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 IGFL3Q6UXB1 125 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT73Q86Y46 540 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 P3H2Q8IVL5 708 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKFN1Q8N957 763 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 HIPK4Q8NE63 616 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OR10A6Q8NH74 314 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MTERF3Q96E29 417 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHL28Q9NXS3 571 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ANGPT4Q9Y264 503 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FRG2CA6NGY1 282 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CBR3O75828 277 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNGR4O95473 234 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 DRD5P21918 477 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V1E1P36543 226 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 XKR7Q5GH72 579 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 EPGNQ6UW88 154 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR18Q8N4B5 295 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FIG4Q92562 907 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 VSTM2LQ96N03 204 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 BTBD2Q9BX70 525 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 WIF1Q9Y5W5 379 aa5.95□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR14LQ5THK1 2151 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM234BA2RU67 622 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GMNCA6NCL1 334 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SNNO75324 88 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NTN1O95631 604 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 UQCRBP14927 111 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 NQO1P15559 274 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ACVR2AP27037 513 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 IL12AP29459 219 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ARFIP1P53367 373 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CRISP3P54108 245 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 BPIFB3P59826 476 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 PHC1P78364 1004 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SQLEQ14534 574 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 STK11Q15831 433 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 RRM2BQ7LG56 351 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 OR8K3Q8NH51 312 aa5.94□□□□□ -1.46
RRN3P1-201ENST00000514813 SPPL2AQ8TCT8 520 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms