RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	ESPN	B1AK53	854 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	CLOCK	O15516	846 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	CFLAR	O15519	480 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	YES1	P07947	543 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	KRT16	P08779	473 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	UBL4A	P11441	157 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	CREB1	P16220	341 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	IL32	P24001	234 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	EDNRA	P25101	427 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	CCR4	P51679	360 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	QPRT	Q15274	297 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	OR5W2	Q8NH69	310 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	MOAP1	Q96BY2	351 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	DUSP26	Q9BV47	211 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	GP6	Q9HCN6	339 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SNHG4-208	ENST00000514110	SERINC4	A6NH21	518 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110		C9JVG2	144 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OVOL3	O00110	214 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF264	O43296	627 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TMCC2	O75069	709 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SOX30	O94993	753 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	H6PD	O95479	791 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SOD3	P08294	240 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NUDT17	P0C025	328 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	DANCR	P0C864	163 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	G6PD	P11413	515 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MATN1	P21941	496 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC7A1	P30825	629 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SOAT1	P35610	550 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SERPINB5	P36952	375 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RAC3	P60763	192 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SKP2	Q13309	424 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TNK1	Q13470	666 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PGS1	Q32NB8	556 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	HSD17B8	Q92506	261 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	MDFI	Q99750	246 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PSD2	Q9BQI7	771 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	BCO1	Q9HAY6	547 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	FCMR	O60667	390 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CYTIP	O60759	359 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	DNAJA2	O60884	412 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	LYZL6	O75951	148 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	BPGM	P07738	259 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CD3E	P07766	207 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OR3A2	P47893	321 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CASP9	P55211	416 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CLDN8	P56748	225 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	C21orf58	P58505	322 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	PPP2R2B	Q00005	443 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	CBFB	Q13951	182 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	P2RY6	Q15077	328 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	GPR68	Q15743	365 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF141	Q15928	474 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110		Q6ZT83	130 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SNHG4-208	ENST00000514110	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68

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