RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR4P57081 412 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CASP8Q14790 479 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 QPRTQ15274 297 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF141Q15928 474 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARL8AQ96BM9 186 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARSGQ96EG1 525 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAT2Q9GZY6 243 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2CD3Q4AC94 2353 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDHDO14521 159 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIAH2O43255 324 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UGT2B17O75795 530 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSTAP01040 98 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD53P19397 219 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGTR1P30556 359 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC7A1P30825 629 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UFM1P61960 85 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OGFOD2Q6N063 350 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BEND4Q6ZU67 534 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFP90Q8TF47 636 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THAP1Q9NVV9 213 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR45Q9Y484 360 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTORP42345 2549 aa20.83■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KITP10721 976 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KHKP50053 298 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SELENBP1Q13228 472 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A53Q5H9E4 307 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAXO2Q658L1 398 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C22orf34Q6ZV56 151 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF128Q8TEB7 428 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABHD3Q8WU67 409 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF524Q96C55 264 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROPN1LQ96C74 230 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEURL3Q96EH8 262 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX37Q96LM6 180 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AIG1Q9NVV5 245 aa20.82■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8OA6NCC3 632 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPC5OSA6NMA1 111 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GOLGA8NF8WBI6 632 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HDAC3O15379 428 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKD3O94806 890 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NTN1O95631 604 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP3CBP16298 524 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAM8P78325 824 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SKP2Q13309 424 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPAT3Q53EU6 434 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATG16L1Q676U5 607 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAC2Q6ZMT1 411 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCRLAQ7L513 359 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC115Q96NT0 180 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBTD1Q9HAC8 227 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLE3Q9NRF9 147 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.81■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PNR3 127 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9JVG2 144 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0513O60268 411 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERLIN1O75477 346 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGCP20142 388 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPHA3P29320 983 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAPK14Q16539 360 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NXNQ6DKJ4 435 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUSC5Q8IXB3 177 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM234Q8WY98 164 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST8SIA1Q92185 356 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR52E6Q96RD3 313 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PANX1Q96RD7 426 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB18Q99592 522 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.8■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC154A6NI56 674 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SESN3P58005 492 aa20.79■□□□□ 0.92
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPCAP84074 193 aa20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms