RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497508.1

TMEM18-208, Transcript of transmembrane protein 18, human

TSL 2

Gene TMEM18, Length 1,706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM18-208	ENST00000497508	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TMEM18-208	ENST00000497508	TTC36	A6NLP5	189 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PEX12	O00623	359 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PRAMEF2	O60811	474 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ITGB2	P05107	769 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	NID1	P14543	1247 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	GSTM3	P21266	225 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	EMD	P50402	254 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	LSAMP	Q13449	338 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	NSDHL	Q15738	373 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	MAPK14	Q16539	360 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	VSTM2L	Q96N03	204 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508		A6NL46	340 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	KCNK2	O95069	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	IGHE	P01854	428 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	MT-ND2	P03891	347 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	POU1F1	P28069	291 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CCL11	P51671	97 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	MVK	Q03426	396 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FUT7	Q11130	342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CCDC103	Q8IW40	242 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	DOK1	Q99704	481 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	LHPP	Q9H008	270 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508		A0A087WUU8	490 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FMO6P	O60774	539 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	COX6A1	P12074	109 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SSTR4	P31391	388 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF136	P52737	540 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PSG6	Q00889	435 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	LY6D	Q14210	128 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	DECR1	Q16698	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FAR1	Q8WVX9	515 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	HRK	O00198	91 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	IFNA16	P05015	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PEX19	P40855	299 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	TMBIM6	P55061	237 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	HOXC5	Q00444	222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TMEM18-208	ENST00000497508	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.43	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms