RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CFL2	Q9Y281	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.92	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A0J9YW62	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SEC14L5	O43304	696 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GMFG	O60234	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	COQ9	O75208	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CDH16	O75309	829 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KCNK2	O95069	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NTN1	O95631	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PLAT	P00750	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	NGFR	P08138	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	MYL2	P10916	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	BCKDHA	P12694	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	HK1	P19367	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TAC1	P20366	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	IL12B	P29460	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CRHR1	P34998	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	UGT2B10	P36537	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CPOX	P36551	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ETV4	P43268	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PCYT1A	P49585	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PRIM2	P49643	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DGKQ	P52824	942 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SIRPA	P78324	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF117	Q03924	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FOXF1	Q12946	379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	HSPB3	Q12988	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PTGR1	Q14914	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CCT7	Q99832	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
UBE3C-208	ENST00000497368		A0A1W2PRB8	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBE3C-208	ENST00000497368	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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