RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	P2RY12	Q9H244	342 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SSX5	O60225	188 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HTR1F	P30939	366 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IL13RA1	P78552	427 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NNAT	Q16517	81 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RBP7	Q96R05	134 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	MED20	Q9H944	212 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SOCS7	O14512	581 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LIPC	P11150	499 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	WDPCP	O95876	746 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ATP1B1	P05026	303 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GABRB1	P18505	474 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CR2	P20023	1033 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GLP1R	P43220	463 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CLDN12	P56749	244 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CTXN1	P60606	82 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TLE2	Q04725	743 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	NEURL3	Q96EH8	262 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KATNBL1	Q9H079	304 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SOCS6	O14544	535 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PHYH	O14832	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	P2RY14	Q15391	338 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	IMPA1	P29218	277 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GNMT	Q14749	295 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PEA15	Q15121	130 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HHATL	Q9HCP6	504 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1B0GV50	99 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	C6	P13671	934 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LTB	Q06643	244 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	LRRC46	Q96FV0	321 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	PRRT1	Q99946	306 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	RREB1	Q92766	1687 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TAS2R19	P59542	299 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	TEX261	Q6UWH6	196 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574		U3KQ87	197 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF726	A6NNF4	738 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf105	O95561	183 aa		13.24	□□□□□ -0.29
PKD1-222	ENST00000496574	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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