RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RLIM	Q9NVW2	624 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	LUZP4	Q9P127	313 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DLGAP1	O14490	977 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TSPAN2	O60636	221 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ABCB7	O75027	752 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	UGT2B11	O75310	529 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	UMOD	P07911	640 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ICAM2	P13598	275 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NAGA	P17050	411 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TRAM2	Q15035	370 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PDK3	Q15120	406 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	KLHL26	Q53HC5	615 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OR4C3	Q8NH37	302 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	C8orf44	Q96CB5	159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FEV	Q99581	238 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CLDN24	A6NM45	220 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OR10H3	O60404	316 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TPST2	O60704	377 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	UTS2	O95399	124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CSTA	P01040	98 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IL18R1	Q13478	541 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	EFR3A	Q14156	821 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NPTX1	Q15818	432 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	KRT80	Q6KB66	452 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF613	Q6PF04	617 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ELP5	Q8TE02	316 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OMA1	Q96E52	524 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PQ72	361 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PQD3	144 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC16A6	O15403	523 aa		11.27	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms