RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 OR51I1Q9H343 314 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 DUXAA6NLW8 204 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 AK1P00568 194 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 UBL4AP11441 157 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 STX3Q13277 289 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 GPR68Q15743 365 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 MAPK14Q16539 360 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PDSS1Q5T2R2 415 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 OGFOD2Q6N063 350 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF614Q8N883 585 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 OR4A15Q8NGL6 344 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 MKLN1Q9UL63 735 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 STX11O75558 287 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 GUSBP08236 651 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 LBPP18428 481 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PLAURQ03405 335 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 QPRTQ15274 297 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SAXO2Q658L1 398 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 FAM71CQ8NEG0 241 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 ZFP90Q8TF47 636 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 LAT2Q9GZY6 243 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SDHDO14521 159 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 FOSL1P15407 271 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SELENBP1Q13228 472 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 BEND4Q6ZU67 534 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 IGFBPL1Q8WX77 278 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 PIP5K1AQ99755 562 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 SAP130Q9H0E3 1048 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 CENPHQ9H3R5 247 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 C12orf49Q9H741 205 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 KCNK9Q9NPC2 374 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL13Q9P2N7 655 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA0513O60268 411 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 H6PDO95479 791 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 OR12D1P0DN82 309 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 PPP3CBP16298 524 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 UQCRC2P22695 453 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 CBFBQ13951 182 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ACKR1Q16570 336 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 TFAP2EQ6VUC0 442 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 TUSC5Q8IXB3 177 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 GABRG1Q8N1C3 465 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 RFWD2Q8NHY2 731 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 RAB8BQ92930 207 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 NEURL3Q96EH8 262 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 GP6Q9HCN6 339 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PNR3 127 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ENPP1P22413 925 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 IL12AP29459 219 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 PGM1P36871 562 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ANXA8L1Q5VT79 327 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 FRRS1Q6ZNA5 592 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 FCRLAQ7L513 359 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 KIRREL3Q8IZU9 778 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ZG16BQ96DA0 208 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 POM121Q96HA1 1249 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC115Q96NT0 180 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 OR10A4Q9H209 315 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 CADP27708 2225 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ZANQ9Y493 2812 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 NAV3Q8IVL0 2385 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 GJE1A6NN92 205 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 E9PBE3 544 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 SNNO75324 88 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 UFM1P61960 85 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 TIGD2Q4W5G0 525 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 ACTR6Q9GZN1 396 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB3-211ENST00000490677 UBTD1Q9HAC8 227 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.7 ms