RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 YIF1AO95070 293 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 F13BP05160 661 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ALPIP09923 528 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RPA2P15927 270 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CPT2P23786 658 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 AGTR1P30556 359 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GGT2P36268 569 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 IFNGR2P38484 337 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC19A1P41440 591 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOPP49908 381 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MAXP61244 160 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TM4SF20Q53R12 229 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 EOGTQ5NDL2 527 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PARGQ86W56 976 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR7G2Q8NG99 324 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 EDEM1Q92611 657 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF516Q92618 1163 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM162AQ96A26 154 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 RTP4Q96DX8 246 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CPB2Q96IY4 423 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SPATA13Q96N96 652 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 TGM7Q96PF1 710 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 INTS14Q96SY0 518 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 PRRX2Q99811 253 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CHIAQ9BZP6 476 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MFFQ9GZY8 342 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-208ENST00000471759 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-208ENST00000471759 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-208ENST00000471759 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGGTB-208ENST00000471759 OR5H1A6NKK0 313 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF726A6NNF4 738 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FRS3O43559 492 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 MOSPD3O75425 235 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2J2O76002 312 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2A4O95047 310 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGGTB-208ENST00000471759 MELTFP08582 738 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CFHP08603 1231 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 HKR1P10072 659 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 ADCYAP1P18509 176 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC2A5P22732 501 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NFYBP25208 207 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 YWHAQP27348 245 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GABRR2P28476 465 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CRYBB2P43320 205 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC11A1P49279 550 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CASP7P55210 303 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CTBP2P56545 445 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFA6P56556 154 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SELENOTP62341 195 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 CHIT1Q13231 466 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GUK1Q16774 197 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 VMACQ2NL98 169 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGGTB-208ENST00000471759 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.16□□□□□ -1.42
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