RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 PKP1Q13835 747 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 PDK2Q15119 407 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 CCNG2Q16589 344 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 SSX8Q7RTT4 187 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 SETD9Q8NE22 299 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 SGCDQ92629 289 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNJ9Q92806 393 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 NXNL1Q96CM4 212 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 MTBPQ96DY7 904 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SFXN2Q96NB2 322 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 DUX5Q96PT3 197 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 PINK1Q9BXM7 581 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 ACTR8Q9H981 624 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 BEX1Q9HBH7 125 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF175Q9Y473 711 aa3.5□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.5□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 C17orf105B2RV13 164 aa3.49□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 AHCYL1O43865 530 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 OR1I1O60431 355 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 ANXA9O76027 345 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SEC14L2O76054 403 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 STAMBPO95630 424 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A8O95907 504 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPIND1P05546 499 aa3.49□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 TYK2P29597 1187 aa3.49□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX2P48431 317 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 GEMP55040 296 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
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ECHDC1-211ENST00000460558 STX4Q12846 297 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 P2RY6Q15077 328 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 PON3Q15166 354 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 BCL2A1Q16548 175 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC18A3Q16572 532 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 PCID2Q5JVF3 399 aa3.49□□□□□ -1.85
ECHDC1-211ENST00000460558 SAXO2Q658L1 398 aa3.49□□□□□ -1.85
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