RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC190Q86UF4 302 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM163Q8TC26 289 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf173Q96LM9 149 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRFN5Q96NI6 719 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM237Q96Q45 408 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMC6Q96SB8 1091 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCTPQ9UKL6 214 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCN2AQ99250 2005 aa7.73□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G3V2L1 256 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPEO14579 308 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLRA3O75311 464 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UMODP07911 640 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HBQ1P09105 142 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFNA3P52797 238 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G16P53816 162 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BPIFB3P59826 476 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP2R2BQ00005 443 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC20Q12834 499 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNC50Q53HI1 259 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCNYL1Q8N7R7 359 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMER3Q8N944 861 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC63Q8NA47 563 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC45A3Q96JT2 553 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F2RL3Q96RI0 385 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INTS14Q96SY0 518 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLNQ9BYT8 704 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DRC3Q9H069 523 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHBGQ9H310 441 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTR8Q9H981 624 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0B4J293 547 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARGFXA6NJG6 315 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C21orf140B9A014 251 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLIN3O60664 434 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUPT7LO94864 414 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GBAP04062 536 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS17P08708 135 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYL2P10916 166 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAC1P20366 129 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCNG1P51959 295 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UCNP55089 124 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTN3A2P78410 334 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGS1Q08116 209 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACSM1Q08AH1 577 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAF3Q13114 568 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VWC2Q2TAL6 325 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYVN1Q86TM6 617 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf107Q8IVU9 208 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IQCKQ8N0W5 287 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BANPQ8N9N5 519 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR7G3Q8NG95 312 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NT5CQ8TCD5 201 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C8orf44Q96CB5 159 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A10Q96PG2 267 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNA7Q96RP8 456 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HBEGFQ99075 208 aa7.71□□□□□ -1.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms