RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1B0GVL5 298 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRKAB2O43741 272 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CACNG3O60359 315 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AP2A1O95782 977 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD55P08174 381 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNNI1P19237 187 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACVR1BP36896 505 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGDIBP52566 201 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP10-3P60369 221 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FCHO2Q0JRZ9 810 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF154Q13106 437 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C1orf61Q13536 156 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LAGE3Q14657 143 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LTB4RQ15722 352 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCL14Q16627 93 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC25A52Q3SY17 297 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF506Q5JVG8 444 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDZK1Q5T2W1 519 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LCE3CQ5T5A8 94 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAET1LQ5VY80 246 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2A2Q6IF42 318 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF491Q8N8L2 437 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNG3Q8TAE7 436 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BADQ92934 168 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC00479Q96M42 142 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHP1Q99653 195 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HCAR1Q9BXC0 346 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YY1AP1Q9H869 796 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLE4Q9NR33 117 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL36GQ9NZH8 169 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BFARQ9NZS9 450 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTSZQ9UBR2 303 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCML2Q9UQR0 700 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 METP08581 1390 aa4□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1B0GTH9 108 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF487B1APH4 448 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 L7N2F9 121 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SOCS3O14543 225 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HPP00738 406 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHG4P01861 327 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ALOX5P09917 674 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP2B6P20813 491 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD80P33681 288 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NF2P35240 595 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRYBB2P43320 205 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYKP43405 635 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STARP49675 285 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATP4BP51164 291 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VLDLRP98155 873 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL18Q14116 193 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ11Q14654 390 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C9orf66Q5T8R8 295 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RFWD3Q6PCD5 774 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRSS48Q7RTY5 328 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM184AQ8NB25 1140 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR9A4Q8NGU2 314 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF597Q96LX8 424 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC38A2Q96QD8 506 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLCC1Q96S66 551 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPATA16Q9BXB7 569 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEK6Q9HC98 313 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMCO3A2RU48 225 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PP2D1A8MPX8 630 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCP11X1B4DZS4 312 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C9JVG2 144 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 E9PLD3 99 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 H3BMQ9 156 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WRBO00258 174 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CASC3O15234 703 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EFNA2O43921 213 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CXCL13O43927 109 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF883P0CG24 379 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CT45A10P0DMU9 189 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BCL3P20749 454 aa3.98□□□□□ -1.77
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANXA13P27216 316 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms