RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A1W2PQ09 198 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM227AF5H4B4 570 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C1orf105O95561 183 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADRA1AP35348 466 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRLHRP49683 370 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MC2RQ01718 297 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MGAT3Q09327 533 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GGTA1PQ4G0N0 100 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SBSNQ6UWP8 590 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR7G1Q8NGA0 311 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYH6P13533 1939 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MXE2 369 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCR7P32248 378 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 POU4F3Q15319 338 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NR0B2Q15466 257 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1Q1Q15612 314 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DUSP7Q16829 419 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC35F3Q8IY50 421 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZFAND1Q8TCF1 268 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD207Q9UJ71 328 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERPINE2P07093 398 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TNFSF8P32971 234 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR22Q8IZ63 422 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C22orf15Q8WYQ4 148 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPAP1Q9NZP6 1156 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HHLA1C9JL84 531 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GABRPO00591 440 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MSL3P1P0C860 447 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPS2P15880 293 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AOAHP28039 575 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IDUAP35475 653 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PEA15Q15121 130 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CBLCQ9ULV8 474 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD300LBA8K4G0 201 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H3BML4 177 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BMP4P12644 408 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GIFP27352 417 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VRK2Q86Y07 508 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM174AQ8TBP5 190 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GTF2H4Q92759 462 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR6C2Q9NZP2 312 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A0A0U1RQS6 177 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEIS3P1A6NDR6 274 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 F5H5K5 113 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF28P17035 718 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SFTPDP35247 375 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPRED1Q7Z699 444 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SERPINA12Q8IW75 414 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ESX1Q8N693 406 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 STEAP2Q8NFT2 490 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TXNDC15Q96J42 360 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IL13RA1P78552 427 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSSK4Q6SA08 328 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HHLA2Q9UM44 414 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ALPLP05186 524 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMP2P16035 220 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GABRR1P24046 479 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPS5P46782 204 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LTBQ06643 244 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MZT1Q08AG7 82 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IRF4Q15306 451 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.98□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A31Q9H0C2 315 aa13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms