RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.66□□□□□ -0.06
VARS-216ENST00000428445 HTRA1Q92743 480 aa14.66□□□□□ -0.06
VARS-216ENST00000428445 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.66□□□□□ -0.06
VARS-216ENST00000428445 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.66□□□□□ -0.06
VARS-216ENST00000428445 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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VARS-216ENST00000428445 TIGARQ9NQ88 270 aa14.66□□□□□ -0.06
VARS-216ENST00000428445 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.66□□□□□ -0.06
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VARS-216ENST00000428445 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 THBS1P07996 1170 aa14.64□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 ATP6V1C1P21283 382 aa14.64□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 IGHV1-2P23083 117 aa14.64□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 ELK4P28324 431 aa14.64□□□□□ -0.07
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VARS-216ENST00000428445 C1orf50Q9BV19 199 aa14.63□□□□□ -0.07
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VARS-216ENST00000428445 GJE1A6NN92 205 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 TMEM114B3SHH9 223 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 ABCD4O14678 606 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 KRT4P19013 534 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 MAPK1P28482 360 aa14.62□□□□□ -0.07
VARS-216ENST00000428445 SLC7A1P30825 629 aa14.62□□□□□ -0.07
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