RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 PGBD2Q6P3X8 592 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 COMTD1Q86VU5 262 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 CNBD2Q96M20 576 aa8.8□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 MUS81Q96NY9 551 aa8.8□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 PITX2Q99697 317 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.8□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.8□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 BLOC1S6Q9UL45 172 aa8.8□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.8□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.79□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GWA3 101 aa8.79□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 Q96MT0 163 aa8.79□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 FRMD6Q96NE9 622 aa8.79□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.79□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.79□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 ZAR1LA6NP61 321 aa8.78□□□□□ -1
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HDLBP-211ENST00000425989 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 LYPD3O95274 346 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 PRG2P13727 222 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 BMP7P18075 431 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 CXCR1P25024 350 aa8.78□□□□□ -1
HDLBP-211ENST00000425989 HTR2AP28223 471 aa8.78□□□□□ -1
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