RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNPY4Q8N129 248 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF527Q8NB42 609 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTERF3Q96E29 417 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGUQ9H490 435 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS50Q9UI38 385 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARD8Q9Y2G2 431 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.66□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BNH8 94 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AZIN1O14977 448 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX4O60224 188 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLIN3O60664 434 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX5AP20674 150 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASMTP46597 345 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS12P56730 875 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAC3P60763 192 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLC1Q15049 377 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC153Q494R4 210 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL26Q53HC5 615 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC73Q6P1J9 531 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX8Q7RTT4 187 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR119Q8TDV5 335 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHNO1Q9BSD3 238 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXSMQ9NWU1 459 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.65□□□□□ -0.54
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A096LNT2 108 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PNR3 127 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPM1 405 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCD4O14678 606 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPRIN2O60269 458 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDNRAP25101 427 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT6P53370 316 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCST2Q5T1A1 773 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP6Q5VW22 663 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPMQ5VYY2 423 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF614Q8N883 585 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC63Q8NA47 563 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUCL1Q96DR8 90 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBB1Q9H4B7 451 aa11.64□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYTIPO60759 359 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H6PDO95479 791 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM157CP0CG43 387 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GGT1P19440 569 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTNP21246 168 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-2P23083 117 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPCAL1P37235 193 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR4P51679 360 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP12AP54707 1039 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNTL6Q49A17 601 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf33Q6P1S2 294 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2W6PQ8NHA6 318 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF524Q96C55 264 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RADILQ96JH8 1075 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACTRT3Q9BYD9 372 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF724A8MTY0 619 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C9JVG2 144 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3orf80F5H4A9 247 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGM3O95394 542 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHEK2O96017 543 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT16P08779 473 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00032P0C843 101 aa11.63□□□□□ -0.55
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCKDHAP12694 445 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms