RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 SLC2A7Q6PXP3 512 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LCTLQ6UWM7 567 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PACS1Q6VY07 963 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ABHD13Q7L211 337 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LACC1Q8IV20 430 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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PTPRK-210ENST00000415055 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PLPP5Q8NEB5 264 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SMPDL3AQ92484 453 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 KAT2AQ92830 837 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OR2A5Q96R48 311 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MED18Q9BUE0 208 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 REG4Q9BYZ8 158 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 NUF2Q9BZD4 464 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 OPA3Q9H6K4 179 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-210ENST00000415055 FEZF1A0PJY2 475 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF487B1APH4 448 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 HSPB6O14558 160 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CHST10O43529 356 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SLC25A17O43808 307 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TRAPPC6AO75865 159 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZFAND5O76080 213 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 EPPINO95925 133 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 VPREB1P12018 145 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 IL10P22301 178 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CTNNA2P26232 953 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 FOXN2P32314 431 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 ALDH3A2P51648 485 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 UBE2HP62256 183 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SKP1P63208 163 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 KCNJ2P63252 427 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TUBA4AP68366 448 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 PHKG1Q16816 387 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 DEFB134Q4QY38 66 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ESCO2Q56NI9 601 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 IGSF11Q5DX21 431 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 XKR6Q5GH73 641 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF425Q6IV72 752 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 RTL4Q6ZR62 310 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 DDIASQ8IXT1 998 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 TEX45Q8NA69 505 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 Q8NFD4 153 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-210ENST00000415055 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ATL1Q8WXF7 558 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 LPGAT1Q92604 370 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 NCLNQ969V3 563 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF570Q96NI8 536 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-210ENST00000415055 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 41.3
PTPRK-210ENST00000415055 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.08□□□□□ -1.76
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