RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 EXPH5Q8NEV8 1989 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 OR6C76A6NM76 312 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 M0R082 166 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 REM1O75628 298 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ONECUT2O95948 504 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 FGF5P12034 268 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ADH7P40394 386 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 MEDAGQ5VYS4 303 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ULK3Q6PHR2 472 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00114Q6XXX2 140 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 FANK1Q8TC84 345 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFAND2BQ8WV99 257 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 OR52D1Q9H346 318 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM5Q9Y2B1 443 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 BDP1A6H8Y1 2624 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SCDO00767 359 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TO15178 435 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ICOSLGO75144 302 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 HPGDP15428 266 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 AVPR2P30518 371 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TGFBR2P37173 567 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM34P42696 430 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 NFATC3Q12968 1075 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 AQP6Q13520 282 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CTF1Q16619 201 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 HSDL2Q6YN16 418 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK20Q8IZL9 346 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF441Q8N8Z8 693 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 OIT3Q8WWZ8 545 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 PRRG3Q9BZD7 231 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF26BQ2KJY2 2108 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 VSTM2BA6NLU5 285 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SURF4O15260 269 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPAN2O60636 221 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ALOX12BO75342 701 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 UBL4AP11441 157 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TBXA2RP21731 343 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF440Q8IYI8 595 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 BMPERQ8N8U9 685 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 OR13C2Q8NGS9 318 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ENKD1Q9H0I2 346 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 HHATLQ9HCP6 504 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 MPDZO75970 2070 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 GNB5O14775 395 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 GABARAPO95166 117 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 IL12BP29460 328 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 LIPAP38571 399 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 GRK6P43250 576 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SKP2Q13309 424 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TIGD6Q17RP2 521 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 OR2T33Q8NG76 320 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 UBQLN3Q9H347 655 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CARD8Q9Y2G2 431 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 KMT2EQ8IZD2 1858 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 EFCAB9A8MZ26 197 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SAGP10523 405 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF28P17035 718 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 PLCXD2Q0VAA5 305 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 IL11RAQ14626 422 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SPCS2Q15005 226 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CBLN3Q6UW01 205 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SLCO6A1Q86UG4 719 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC34A3Q8N130 599 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 OMA1Q96E52 524 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CRELD1Q96HD1 420 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM80Q96HE8 168 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SPSB2Q99619 263 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 RTN4RQ9BZR6 473 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SIGLEC7Q9Y286 467 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 WDFY4Q6ZS81 3184 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SAGE2PA6NJ88 616 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 MEN1O00255 615 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC2A10O95528 541 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CD36P16671 472 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 EMP2P54851 167 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 NCF4Q15080 339 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 DBX2Q6ZNG2 339 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 P2RY8Q86VZ1 359 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 AGBL5Q8NDL9 886 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKK1Q8NFD2 765 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 C3orf49Q96BT1 292 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPBAP1Q96EW2 488 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 SEMA4CQ9C0C4 833 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5-204ENST00000412806 FRYLO94915 3013 aa19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms