RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402583.5

CBX1-203, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene CBX1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-203ENST00000402583 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 POLHQ9Y253 713 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR10H1Q9Y4A9 318 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 A0A1B0GWA3 101 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 A0A1W2PR77 199 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DAPL1A0PJW8 107 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FITM1A5D6W6 292 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CASKO14936 926 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 AQP9O43315 295 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FOXS1O43638 330 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PTP4A3O75365 173 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 APOL3O95236 402 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 NTN1O95631 604 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MT-ND5P03915 603 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 IFNA16P05015 189 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ARL4DP49703 201 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FOXK2Q01167 660 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MXD1Q05195 221 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SCN1BQ07699 218 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FUT7Q11130 342 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DOC2BQ14184 412 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 XKRXQ6PP77 449 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SHFQ7M4L6 423 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OAFQ86UD1 273 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ZNF527Q8NB42 609 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.59□□□□□ -1.03
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CBX1-203ENST00000402583 TM9SF4Q92544 642 aa8.59□□□□□ -1.03
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CBX1-203ENST00000402583 NACC2Q96BF6 587 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MAP3K3Q99759 626 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 OR10A5Q9H207 317 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1-203ENST00000402583 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 SERINC4A6NH21 518 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 LMO7DNF2Z398 122 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 NPIPB9F8W1W9 429 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 J3QRE1 110 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 SOCS6O14544 535 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 HCRTR1O43613 425 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 NDUFB2O95178 105 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 SLC2A10O95528 541 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 CSTAP01040 98 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 PEPDP12955 493 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 CELP19835 753 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 TBXA2RP21731 343 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 F8A1P23610 371 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 NOS3P29474 1203 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 LCN1P31025 176 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 SSTR4P31391 388 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 GPR3P46089 330 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 FABP5Q01469 135 aa8.58□□□□□ -1.04
CBX1-203ENST00000402583 LGALS3BPQ08380 585 aa8.58□□□□□ -1.04
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