RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 GPR65Q8IYL9 337 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 CNIH3Q8TBE1 160 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 MYLPFQ96A32 169 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 DUSP16Q9BY84 665 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 IKZF5Q9H5V7 419 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 RMND5AQ9H871 391 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 AIPL1Q9NZN9 384 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CHMP5Q9NZZ3 219 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 DPM3Q9P2X0 92 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 LMTK2Q8IWU2 1503 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ERBINQ96RT1 1412 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 UACAQ9BZF9 1416 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ATP10DQ9P241 1426 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF11O15085 1522 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 STAMBPO95630 424 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 IQCF3P0C7M6 154 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC166P0CW27 439 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 ATP6V1C1P21283 382 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 TAF6P49848 677 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 ARPC4P59998 168 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 CCDC183Q5T5S1 534 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PYHIN1Q6K0P9 492 aa2.34□□□□□ -2.03
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PTPRC-205ENST00000391970 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 Q6ZR54 194 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 GPR137CQ8N3F9 429 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 OR2T33Q8NG76 320 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 SUN5Q8TC36 379 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-205ENST00000391970 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
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