RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 KDM1BQ8NB78 822 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SYT5O00445 386 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SCAMP1O15126 338 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM127O75204 238 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC22A5O76082 557 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FABP1P07148 127 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ACP2P11117 423 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FCGR2AP12318 317 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 DSC1Q08554 894 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SULF2Q8IWU5 870 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR56B4Q8NH76 319 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C7orf34Q96L11 122 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 KCNJ15Q99712 375 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 FZD3Q9NPG1 666 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LRIT2A6NDA9 550 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PTGESO14684 152 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 STATHP02808 62 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CAV2P51636 162 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CTXN1P60606 82 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR4K13Q8NH42 304 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 POLHQ9Y253 713 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 AKAP6Q13023 2319 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 APOC3P02656 99 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 AKR1C4P17516 323 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NOVP48745 357 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 NFATC4Q14934 902 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ASB11Q8WXH4 323 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PEX11GQ96HA9 241 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SCN1AP35498 2009 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GOSR2O14653 212 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ETV4P43268 484 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CD97P48960 835 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 UGT8Q16880 541 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZSR6 202 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR5B2Q96R09 309 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 ACPTQ9BZG2 426 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 LILRB5O75023 590 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 GABRA5P31644 462 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 CATR1Q13166 79 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PLGLAQ15195 96 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 WDTC1Q8N5D0 677 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 OR2M2Q96R28 347 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRT-201ENST00000356100 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 MROH6A6NGR9 719 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 H0YIV9 168 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 FANCGO15287 622 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 CDK1P06493 297 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 GALNT10Q86SR1 603 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 ELP4Q96EB1 424 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 COQ10AQ96MF6 247 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 BCORQ6W2J9 1755 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 NHSL1Q5SYE7 1610 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0D9SG52 128 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 A8MVM7 634 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R3DO95685 299 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 SLURP2P0DP57 97 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 GGT5P36269 586 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 DLX5P56178 289 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 ERVPABLB-1P60509 514 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 IL13RA1P78552 427 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 SORT1Q99523 831 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRT-201ENST00000356100 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms