RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 E2F1Q01094 437 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 KIR2DS3Q14952 304 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ANGPT1Q15389 498 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SDE2Q6IQ49 451 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR4C6Q8NH72 309 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PMM1Q92871 262 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR2A5Q96R48 311 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 KCNE5Q9UJ90 142 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 HSPB11Q9Y547 144 aa16.89■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0A6YYJ9 748 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 C7orf66A4D0T2 115 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ATP1B1P05026 303 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 IL9P15248 144 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 BTCP35070 178 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF85Q03923 595 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 POU4F2Q12837 409 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC58Q4VC31 144 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM240Q5SV17 173 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF613Q6PF04 617 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD13Q7L211 337 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GPR135Q8IZ08 494 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 GHDCQ8N2G8 530 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TEX19Q8NA77 164 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 C17orf47Q8NEP4 570 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SNAPC3Q92966 411 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SFXN1Q9H9B4 322 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL1Q9NR64 748 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SMLR1H3BR10 107 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 J3QLW9 94 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 AKR7A2O43488 359 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CHP2O43745 196 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SOX30O94993 753 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 EML2O95834 649 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF19P17023 458 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NOS3P29474 1203 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NRG3P56975 720 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 C19orf57Q0VDD7 668 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NTRK2Q16620 822 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MS4A15Q8N5U1 240 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FAM131CQ96AQ9 280 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF559Q9BR84 538 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MED28Q9H204 178 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LYRM4Q9HD34 91 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa16.88■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC72A6NJI9 287 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FZD7O75084 574 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ADPRHP54922 357 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ID2Q02363 134 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CRMP1Q14194 572 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 YAF2Q8IY57 180 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLC43A2Q8N370 569 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CAMKVQ8NCB2 501 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SMPDL3BQ92485 455 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD1Q96SE0 405 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DPAGT1Q9H3H5 408 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 EVA1AQ9H8M9 152 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT15Q9NV35 164 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO34Q9NWN3 711 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 STMN3Q9NZ72 180 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TNFSF14O43557 240 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 CTSVO60911 334 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPA8P0DM63 369 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 RAB3BP20337 219 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 OR12D2P58182 307 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 KRT74Q7RTS7 529 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SCMH1Q96GD3 660 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 POLE3Q9NRF9 147 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 SPACA6W5XKT8 324 aa16.87■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 BRINP1O60477 761 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJB6O75190 326 aa16.86■□□□□ 0.29
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R3DO95685 299 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms