RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NT5DC2Q9H857 520 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ASB1Q9Y576 335 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 COL4A3Q01955 1670 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 A0A096LPE4 126 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPZ6 126 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SHISA8B8ZZ34 492 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TM4SF5O14894 197 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TAPBPO15533 448 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FRS3O43559 492 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FOXS1O43638 330 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 LYZL6O75951 148 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CH25HO95992 272 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 PEX19P40855 299 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 UGT2B15P54855 530 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 FOXA1P55317 472 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PRPS1P60891 318 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 MALLQ13021 153 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK2DQ13557 499 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF425Q6IV72 752 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 FCRLAQ7L513 359 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A14Q7RTX9 510 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 KDM8Q8N371 416 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR8S1Q8NH09 359 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR2V1Q8NHB1 315 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 OR52B2Q96RD2 323 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 NMUR2Q9GZQ4 415 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB26Q9HCK0 441 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CROCCQ5TZA2 2017 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF11O14788 317 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 REEP3Q6NUK4 255 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ERICH5Q6P6B1 374 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF283Q8N7M2 679 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD53Q8N9V6 530 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ROPN1LQ96C74 230 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CBX6O95503 412 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA3P01011 423 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 LCATP04180 440 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 HTR3AP46098 478 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 CDK9P50750 372 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PRKXP51817 358 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 PNLIPRP2P54317 469 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 ACTG1P63261 375 aa4.06□□□□□ -1.76
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