RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.67□□□□□ -0.06
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PDGFB-201ENST00000331163 TSC22D2O75157 780 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CNR2P34972 360 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ETV5P41161 510 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.67□□□□□ -0.06
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PDGFB-201ENST00000331163 GASTP01350 101 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PIGUQ9H490 435 aa14.65□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.65□□□□□ -0.06
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