RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGMQ9H3S5 423 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPT1P8Q9HAU6 139 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PACSIN3Q9UKS6 424 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPT1Q9Y234 373 aa17.56■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDZD2O15018 2839 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0J9YW62 118 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF11O14788 317 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXCL13O43927 109 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDF1O60869 148 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP7B1O75881 506 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP8O94778 261 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR2AP12318 317 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ME2P23368 584 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEA8P43361 318 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A8P48029 635 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYBPHQ13203 477 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 QPRTQ15274 297 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUSBP1Q15486 140 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGCBQ16585 318 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWA1Q6PCB0 445 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUZP2Q86TE4 346 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LILRA2Q8N149 483 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRX4Q96LA9 322 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCCC2Q9HCC0 563 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACC2O95359 2948 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSMD2Q7Z408 3487 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN24A6NM45 220 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR5A2O00482 541 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETFAP13804 333 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFTPDP35247 375 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEX19P40855 299 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP4BP51164 291 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD4Q96DR4 205 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF559Q9BR84 538 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC52A3Q9NQ40 469 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRIM1Q9NZV1 1036 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC167Q9P0B6 97 aa17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A096LPI6 279 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP5A6NIR3 686 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR2F1P10589 423 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD1EP15812 388 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN3P20807 821 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRATP43155 626 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DL3P43628 341 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSTNP60981 165 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRPAP78324 504 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SORDQ00796 357 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENBP1Q13228 472 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SQLEQ14534 574 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 HBMQ6B0K9 141 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP4R4Q6NUP7 873 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZZZ3Q8IYH5 903 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST8SIA1Q92185 356 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDL1Q96EA4 605 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 COQ10BQ9H8M1 238 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPHS2Q9NP85 383 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT8Q9NY28 637 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RX2Q9UBL9 471 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCTN4Q9UJW0 460 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSPPQ9NZW4 1301 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM11O75078 769 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 NID1P14543 1247 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGCP20142 388 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPA2P48052 419 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SESN3P58005 492 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ10P78508 379 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDSS1Q5T2R2 415 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRIF1Q5T3J3 769 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTLAQ7Z6A9 289 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSRB3Q8IXL7 192 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR60Q8WVS4 1066 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRXN1Q9BYN0 137 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF385DQ9H6B1 395 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM45AQ9NWC5 275 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPG11Q96JI7 2443 aa17.51■□□□□ 0.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPDZO75970 2070 aa17.51■□□□□ 0.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJE1A6NN92 205 aa17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms