RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAM10O14672 748 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEURL1O76050 574 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 THRBP10828 461 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD46P15529 392 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNR1P21554 472 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 IST1P53990 364 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIPK1Q86Z02 1210 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRMD6Q96NE9 622 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIB1Q99828 191 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf16Q9BUW7 83 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSN1Q9H410 356 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 VNN3Q9NY84 501 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A7Q9UM01 511 aa25.01■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASPMQ8IZT6 3477 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GWA3 101 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRQ8 180 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKUB1A6NFN9 424 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNB5O14775 395 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGCR6Q14129 220 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC36Q1X8D7 754 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCST1Q5T197 706 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 LPCAT4Q643R3 524 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 GDF7Q7Z4P5 450 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLCZ1Q86YW0 608 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1J4Q8NGS1 313 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM9SF4Q92544 642 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM41AQ96HV5 264 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS1Q96LJ7 313 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALPK1Q96QP1 1244 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD19PQ9H560 264 aa25■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACACAQ13085 2346 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 GP1BBP13224 206 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX2P28328 305 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGA2P52926 109 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG10BQ5I7T1 473 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ULK3Q6PHR2 472 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR119Q8TDV5 335 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM234Q8WY98 164 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC38A4Q969I6 547 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRBF2Q96F24 287 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF597Q96LX8 424 aa24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087WV48 116 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNPHO15079 494 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNASE1L1P49184 302 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A25Q6KCM7 469 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRM2BQ7LG56 351 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 STK32CQ86UX6 486 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2M3Q8NG83 312 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 VCXQ9H320 206 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROK2Q9HC23 129 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R10Q9NYW0 307 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0B4J2E0 115 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1B0GX12 115 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM8BA6NDV4 472 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SP1P08047 785 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC1A3P43003 542 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 QPRTQ15274 297 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFL2Q6UWQ7 119 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDSUB1Q8N9V3 476 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDS2Q8NDY4 140 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTNBP1Q96EV8 351 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM173AQ9BQD7 235 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL1Q9NR64 748 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 MKRN2OSH3BPM6 223 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHP2O43745 196 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCNB2O95067 398 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR85P60893 370 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIGD3Q6B0B8 471 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C15Q8NGM1 316 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIPC3Q8TF64 312 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXADRP78310 365 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 MICAQ29983 383 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00471Q8N535 108 aa24.96■■□□□ 1.59
CTDNEP1-201ENST00000318988 FADS6Q8N9I5 356 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms