RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PINK1Q9BXM7 581 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP73A6NFT4 308 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 AP3D1O14617 1153 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 FRS3O43559 492 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 FOXF1Q12946 379 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 VASNQ6EMK4 673 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PRR7Q8TB68 274 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF524Q96C55 264 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.22■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 MYO7BQ6PIF6 2116 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 H3BML4 177 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CXCR6O00574 342 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PRRG2O14669 202 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ACTL6AO96019 429 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 UQCRBP14927 111 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 PRKCAP17252 672 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP24386 653 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 KDELR2P33947 212 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 STARP49675 285 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CRYBA2P53672 197 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP7Q16829 419 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 DCST1Q5T197 706 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF550Q7Z398 422 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 COMTD1Q86VU5 262 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 OR5M9Q8NGP3 310 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 FAM57AQ8TBR7 257 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 RNF145Q96MT1 663 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 TIMP4Q99727 224 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf21Q9H246 121 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF835Q9Y2P0 537 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD4-201ENST00000306324 J3QKU1 62 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 BCKDKO14874 412 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 EPPINO95925 133 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 IFNA14P01570 189 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PRG2P13727 222 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 NCK1P16333 377 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF17P17021 662 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SESN3P58005 492 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 EPS8Q12929 822 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 WLSQ5T9L3 541 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CD163Q86VB7 1156 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 POC1BQ8TC44 478 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 RASSF5Q8WWW0 418 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM234Q8WY98 164 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SMPDL3BQ92485 455 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 MPDZO75970 2070 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 C7orf72A4D263 438 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GP1BBP13224 206 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 HSD17B1P14061 328 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 HTR1EP28566 365 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 KCNJ5P48544 419 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CASP6P55212 293 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 HOXC5Q00444 222 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 BNIP1Q12981 228 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 C3AR1Q16581 482 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GXYLT1Q4G148 440 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ST8SIA1Q92185 356 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CD300AQ9UGN4 299 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 TINAGQ9UJW2 476 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 LINC01387J3KSC0 135 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GMNNO75496 209 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 WISP1O95388 367 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 GGT1P19440 569 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CD247P20963 164 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 COPZ1P61923 177 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 SRYQ05066 204 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CEACAM7Q14002 265 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms