RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303731.8

TRAPPC1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC1, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCL19Q99731 98 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 LAT2Q9GZY6 243 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 POLE3Q9NRF9 147 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 DSCAMO60469 2012 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ROS1P08922 2347 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SERINC4A6NH21 518 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 LBPP18428 481 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 UQCRC2P22695 453 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAC3P60763 192 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 C3orf33Q6P1S2 294 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 FCRLAQ7L513 359 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TMEM234Q8WY98 164 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 C18orf12Q96KH6 178 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 OIP5O43482 229 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 DIAPH2O60879 1101 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 DNAJA2O60884 412 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 YES1P07947 543 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PGCP20142 388 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CCR4P51679 360 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SKP2Q13309 424 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 QPRTQ15274 297 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 GPR68Q15743 365 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 OGFOD2Q6N063 350 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ABHD3Q8WU67 409 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NUDT8Q8WV74 236 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SORT1Q99523 831 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CENPHQ9H3R5 247 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 C12orf49Q9H741 205 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 RAB21Q9UL25 225 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 EFNA2O43921 213 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KIAA0513O60268 411 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SCN2BO60939 215 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CSTAP01040 98 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 THBDP07204 575 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 LOXP28300 417 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SHC1P29353 583 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KHKP50053 298 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 STX3Q13277 289 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 Q5PR19 223 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NUF2Q9BZD4 464 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 OR51I1Q9H343 314 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 BCO1Q9HAY6 547 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 NGBQ9NPG2 151 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 MKLN1Q9UL63 735 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ESPNB1AK53 854 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 E9PBE3 544 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ANKRD28O15084 1053 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 KLF4O43474 513 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 FCMRO60667 390 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 UGT2B17O75795 530 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 BGNP21810 368 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC1-201ENST00000303731 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms