RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 HDAC8Q9BY41 377 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.05■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SLC22A5O76082 557 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CLTBP09497 229 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CRMP1Q14194 572 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 OR1Q1Q15612 314 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ACSM3Q53FZ2 586 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 LNX2Q8N448 690 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 GHSRQ92847 366 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SDF2Q99470 211 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 FKTNO75072 461 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SC5DO75845 299 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CCL5P13501 91 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ARFIP1P53367 373 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PXKQ7Z7A4 578 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 LYPD3O95274 346 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SBK2P0C263 348 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ANXA3P12429 323 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 DRD5P21918 477 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CMC2Q9NRP2 79 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SZT2Q5T011 3432 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CIB4A0PJX0 185 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PPP1R3DO95685 299 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 CTNNB1P35222 781 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SHC2P98077 582 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 POU4F3Q15319 338 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ST3GAL2Q16842 350 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 TP53I3Q53FA7 332 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 MTSS1LQ765P7 747 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 GRHL3Q8TE85 626 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 GIMAP1Q8WWP7 306 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SMPDL3BQ92485 455 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ORAI1Q96D31 301 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 FN3KQ9H479 309 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 EMC7Q9NPA0 242 aa16.03■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 DUXAA6NLW8 204 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ADRB1P08588 477 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 RAB3BP20337 219 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 PLAURQ03405 335 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 FGFBP1Q14512 234 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ANGPT1Q15389 498 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 DEFB134Q4QY38 66 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 THAP4Q8WY91 577 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SIGLEC7Q9Y286 467 aa16.02■□□□□ 0.16
PDE4A-201ENST00000293683 SLC22A31A6NKX4 558 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 TOXO94900 526 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 RAF1P04049 648 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 WNT1P04628 370 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 CEACAM5P06731 702 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFS1P28331 727 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 RPE65Q16518 533 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 RAB7BQ96AH8 199 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC120Q96HB5 630 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 CFHR5Q9BXR6 569 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 BRD7Q9NPI1 651 aa16.02■□□□□ 0.15
PDE4A-201ENST00000293683 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms