RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.97■□□□□ 0.15
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TRPC1-201ENST00000273482 NEU3Q9UQ49 428 aa15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TRPC1-201ENST00000273482 SLCO2B1O94956 709 aa15.95■□□□□ 0.14
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TRPC1-201ENST00000273482 CCR6P51684 374 aa15.95■□□□□ 0.14
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