RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 AMY2AP04746 511 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 XKR7Q5GH72 579 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ENTPD8Q5MY95 495 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CCNJQ5T5M9 372 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF691Q5VV52 312 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SLC6A19Q695T7 634 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 MYADMQ96S97 322 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 HDAC8Q9BY41 377 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OLAHQ9NV23 265 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TOXO94900 526 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 CRHBPP24387 322 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 MAOBP27338 520 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FNTBP49356 437 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 NR0B2Q15466 257 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 FCRLBQ6BAA4 426 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 AWAT2Q6E213 333 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 BORAQ6PGQ7 559 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 TCTN2Q96GX1 697 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 OBP2AQ9NY56 170 aa11.33□□□□□ -0.59
PTPRS-201ENST00000262963 A0A1B0GTL3 188 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 LYRM1O43325 122 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ZFAND5O76080 213 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 OPRL1P41146 370 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ERVK-25P63136 954 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 LMF1Q96S06 567 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 SYT3Q9BQG1 590 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 OR51E2Q9H255 320 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF337Q9Y3M9 751 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF175Q9Y473 711 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 LCATP04180 440 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 CHMP24386 653 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 SLC5A2P31639 672 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM244Q5VVB8 128 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 VRK2Q86Y07 508 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM163Q8TC26 289 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 FAM86C1Q9NVL1 165 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 POU2F3Q9UKI9 436 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 RAB38P57729 211 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TSPAN31Q12999 210 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 OR1Q1Q15612 314 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 NHSL2Q5HYW2 709 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 HYLS1Q96M11 299 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 MS4A8Q9BY19 250 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 SLCO2B1O94956 709 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PTH2RP49190 550 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 RGS6P49758 472 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 CHRNEQ04844 493 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 CNIH2Q6PI25 160 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 LIX1LQ8IVB5 337 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PLPP6Q8IY26 295 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 NXPE3Q969Y0 559 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 CDH20Q9HBT6 801 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 IRS1P35568 1242 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PBX2P40425 430 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TNFRSF17Q02223 184 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ECH1Q13011 328 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 OPN5Q6U736 354 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 C7orf34Q96L11 122 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 CUTCQ9NTM9 273 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM202A6NGA9 273 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms