RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 M0R1B8 84 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 GUCY1B2O75343 617 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 RAD51DO75771 328 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 PRKD3O94806 890 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ANGPTL1O95841 491 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 HKR1P10072 659 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 HTR6P50406 440 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CLCQ05315 142 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 UNC50Q53HI1 259 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 NUP43Q8NFH3 380 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 POC1BQ8TC44 478 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9A6Q92581 669 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZIM3Q96PE6 472 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM237Q96Q45 408 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.35□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PR80 420 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MANBAO00462 879 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ME2P23368 584 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 PRR5P85299 388 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CHRNEQ04844 493 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TRIP10Q15642 601 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CPTPQ5TA50 214 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TRABD2AQ86V40 505 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF382Q96SR6 550 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 PSD2Q9BQI7 771 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 ACPTQ9BZG2 426 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 FKRPQ9H9S5 495 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.34□□□□□ -0.11
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRB8 838 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 B4DSR2 109 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFB5O43674 189 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 HSD3B1P14060 373 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PGCP20142 388 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 HSD3B2P26439 372 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SFTPDP35247 375 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH9A1P49189 494 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CCNIQ14094 377 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 RASA2Q15283 850 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 LILRA2Q8N149 483 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MED17Q9NVC6 651 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MCM8Q9UJA3 840 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PSME2Q9UL46 239 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.33□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 RGS14O43566 566 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PCDH7O60245 1069 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 PLOD3O60568 738 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 IL33O95760 270 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 IL3P08700 152 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD2P08910 425 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 MYZAPP0CAP1 466 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ENPP1P22413 925 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 SLC43A2Q8N370 569 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 OR7G2Q8NG99 324 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM186Q96B77 213 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 TIGARQ9NQ88 270 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 NTMQ9P121 344 aa14.32□□□□□ -0.12
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL9Q9P2J3 617 aa14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms