RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 CXCL3P19876 107 aa20.51■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.49■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 NID1P14543 1247 aa20.49■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.49■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 BTN3A3O00478 584 aa20.48■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 KCNE5Q9UJ90 142 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.48■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 GPR171O14626 319 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 MID1O15344 667 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.48■□□□□ 0.87
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HTATSF1-201ENST00000218364 BMP8BP34820 402 aa20.48■□□□□ 0.87
HTATSF1-201ENST00000218364 DYRK1AQ13627 763 aa20.48■□□□□ 0.87
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