RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	MAP3K8	P41279	467 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF117	Q03924	483 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	MLC1	Q15049	377 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	STK11	Q15831	433 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC43A2	Q8N370	569 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	APOPT1	Q96IL0	206 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	NPHS1	O60500	1241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	PLAU	P00749	431 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	YES1	P07947	543 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	LINGO3	P0C6S8	592 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	UBL4A	P11441	157 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	CBFB	Q13951	182 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	ETFDH	Q16134	617 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	NPAS1	Q99742	590 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	C6orf47	O95873	294 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ADA	P00813	363 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	CHRNG	P07510	517 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	IDUA	P35475	653 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP12A	P54707	1039 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	DMTN	Q08495	405 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	P2RY6	Q15077	328 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SFXN5	Q8TD22	340 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	NF1	P21359	2839 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ACAN	P16112	2415 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	DUXA	A6NLW8	204 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF264	O43296	627 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	AK1	P00568	194 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	FGF4	P08620	206 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	LAMP1	P11279	417 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	PAX1	P15863	534 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	PRKCA	P17252	672 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ENPP1	P22413	925 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SHC1	P29353	583 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINB5	P36952	375 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF844	Q08AG5	666 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	FAP	Q12884	760 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ITGAD	Q13349	1161 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	TAB1	Q15750	504 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	PGS1	Q32NB8	556 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5W2	Q8NH69	310 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM234	Q8WY98	164 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5B2	Q96R09	309 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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