RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636254.1

ARID1B-215, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, humanhuman

TSL 5

Gene ARID1B, Length 3,848 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1B-215ENST00000636254 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.4□□□□□ -1.22
ARID1B-215ENST00000636254 A0A0C4DFX4 3053 aa7.4□□□□□ -1.22
ARID1B-215ENST00000636254 A0A1W2PPL8 197 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 A0A1W2PQ09 198 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 GFYI3L273 518 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 GABARAPO95166 117 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 APOC1P02654 83 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 OSMP13725 252 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 GALP22466 123 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SLC6A12P48065 614 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SOX2P48431 317 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PRLHRP49683 370 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 RBBP4Q09028 425 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 BIKQ13323 160 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TSC22D1Q15714 1073 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SSX2Q16385 188 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 KLHL22Q53GT1 634 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 MPP7Q5T2T1 576 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 OR4C11Q6IEV9 310 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 FGF13Q92913 245 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SAMD8Q96LT4 415 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 DPH1Q9BZG8 443 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 IL21RQ9HBE5 538 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.4□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 DENND4CQ5VZ89 1909 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PLPP1O14494 284 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SLCO2B1O94956 709 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 MBP02144 154 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 POU2F2P09086 479 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ITGAMP11215 1152 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 HSD3B1P14060 373 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 GABRA3P34903 492 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 MTNR1AP48039 350 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 GIPRP48546 466 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 IFITM3Q01628 133 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 OCLNQ16625 522 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 LRIF1Q5T3J3 769 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 Q8N402 240 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 CCDC120Q96HB5 630 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 DUSP21Q9H596 190 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PHF11Q9UIL8 331 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 NUP50Q9UKX7 468 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TTLL8A6PVC2 850 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 B4DGG1 531 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 H7C1Q1 480 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TMPRSS11DO60235 418 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 FMO6PO60774 539 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 CPNE6O95741 557 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 RLN1P04808 185 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 INHBBP09529 407 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 NUDT1P36639 197 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 WNT3P56703 355 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ST3GAL3Q11203 375 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 CPXM2Q8N436 756 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 FAM122AQ96E09 287 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 ACER3Q9NUN7 267 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 TAAR2Q9P1P5 351 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.39□□□□□ -1.23
ARID1B-215ENST00000636254 H7C2Y5 167 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms