RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635392.1

SMARCA2-240, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 291 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-240	ENST00000635392	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		A8MXK9	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		H7C423	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MAPK13	O15264	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	DCX	O43602	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FCGR3A	P08637	254 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LMO2	P25791	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392		Q7L0L9	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	OSTF1	Q92882	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	WBP1	Q96G27	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TXN2	Q99757	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ELP1	O95163	1332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TM9SF1	O15321	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TYROBP	O43914	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SPAG6	O75602	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CLU	P10909	449 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	DLST	P36957	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	THRSP	Q92748	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	ART4	Q93070	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	JPT2	Q9H910	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MYH6	P13533	1939 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NFASC	O94856	1347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	E2F3	O00716	465 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	MFN2	O95140	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	WNT2	P09544	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	PAX7	P23759	505 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	IFNAR2	P48551	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SMARCA2-240	ENST00000635392	SLC26A2	P50443	739 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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